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Os serviços de fabricação Arrayjet Advance™ trabalharam com uma importante empresa de proteômica sediada nos EUA para melhorar sua produção de matriz de proteínas e aumentar seu rendimento, minimizando o desperdício de amostras.

Os Laboratórios CDI sofreram atrasos contínuos na produção, inconsistência entre lotes, perda de rendimento e desperdício de amostras ao trabalhar com o sistema de impressão de pinos de contato de baixo rendimento da empresa; questões que viram os Laboratórios CDI lutarem para produzir as grandes quantidades de matrizes de proteínas de alta qualidade necessárias para atender à demanda.

A empresa estava enfrentando uma pressão significativa para comercializar seu produto de maneira confiável, sem aumentar exponencialmente os custos de manutenção e outros custos de produção.

Histórico do estudo de caso

Os serviços de impressão personalizada Arrayjet Advance™ apoiaram o projeto CDI que foi lançado em 2011. Ao alavancar o serviço de microarray CRO de ponta a ponta da empresa, a CDI Laboratories conseguiu acessar mais de 75 anos de experiência combinada em microarray na sede da Arrayjet.

Isso permitiu a efetiva otimização, comercialização e transferência de tecnologia do array de proteínas da empresa.

Otimização do ensaio

Para iniciar a otimização do ensaio, uma combinação do microarrayer Ultra Marathon II da Arrayjet com o controle ambiental JetMosphere Max ™ (definido para 4 ° C) foi usada para imprimir um subconjunto direcionado de proteínas da biblioteca de proteínas humanas do CDI em epoxisilano (Figura 2) e superfícies de nitrocelulose.

Uma série de diferentes volumes de teste foram dispensados ​​para determinar o volume de deposição ideal. Isso permitiu a impressão de um total de 14 mini arrays idênticos com uma circularidade pontual de >99%. O ensaio e a análise dos miniarrays revelaram o padrão de expressão antecipado.

Impressão em lote

Com os recursos de impressão em pequenos lotes estabelecidos, um subconjunto maior de amostras de proteínas – novamente, da biblioteca de proteínas humanas do CDI – foi localizado em 200 lâminas de epoxisilano e nitrocelulose. Isso foi feito para facilitar a análise adicional da reprodutibilidade do ponto, circularidade e morfologia (Figura 3).

O Jetguard™ da Arrayjet foi empregado para garantir a evaporação mínima da amostra ao longo desta tiragem mais longa.

Impressão de alta densidade

Com os ensaios de proteínas funcionais confirmados, foi possível transferir do pin-spotting para a tecnologia de jato de tinta da Arrayjet.

A próxima etapa do processo envolveu uma investigação sobre os recursos de impressão de alta densidade do microarrayer Ultra Marathon II .

Para avaliar isso, amostras da biblioteca de proteínas humanas do CDI foram impressas em uma matriz hexagonal em alta densidade para avaliar sua reprodutibilidade inter e intra-lâmina em uma variedade de substratos. Também foi importante manter um baixo nível de experiência durante todo esse processo.

Os slides resultantes exibiram alinhamento de pontos consistente e nenhuma evidência de fusão.

Imprimindo toda a biblioteca de proteínas humanas

Um conjunto completo de mais de 19.000 proteínas de fusão GST da biblioteca de proteínas humanas do CDI foi purificado antes de ser impresso em duplicata em 500 slides. Isso foi feito em um volume de deposição de amostra de 200 pL

Os critérios de sucesso acordados foram todos atendidos ao longo deste processo. Estes incluíram:

  • Garantir que >97% dos pontos estivessem presentes em cada slide
  • Garantir que a circularidade pontual fosse > 90%
  • Garantir que os valores do Coeficiente de Variabilidade (CV) inter e intra-lâminas fossem consistentemente <20%

Esses resultados foram verificados como positivos e precisos por meio da análise funcional.

Conclusão

Com a transferência de tecnologia agora concluída e bem-sucedida, os Laboratórios CDI são capazes de produzir o maior microarray de proteoma humano do mundo. A empresa agora pode imprimir seus arrays HuProt™ Versão 3.1 em um total de 1.000 slides em um único lote.

Ao adquirir e empregar o Arrayjet Ultra Marathon II , os Laboratórios CDI podem imprimir proteomas e microarrays personalizados adequados para a análise eficiente de milhares de interações de proteínas internamente, garantindo o uso mínimo de amostras de dados clínicos valiosos.

Ao alavancar o poder do serviço Arrayjet Advance™ e da tecnologia piezoelétrica sem contato, a CDI Laboratories aumentou significativamente sua eficiência de produção para imprimir lotes grandes e de alta qualidade de microarrays de proteínas.

O uso de uma unidade de controle ambiental adequada garante que a excelente morfologia de pontos e alinhamento de matriz sejam mantidos, mantendo simultaneamente e com precisão a conformação nativa das proteínas – um fator chave na produção de ensaios consistentes.

Dr. Ignacio Pino, CEO, CDI Laboratories explica os benefícios deste trabalho:

“A CDI Laboratories comprou um Arrayjet Ultra Marathon II para imprimir microarrays para nossa linha de produtos HuProt™ e para imprimir arrays focados com subconjuntos menores de proteínas para projetos de descoberta e hibridoma.

“A CDI está planejando imprimir matrizes de anticorpos monoclonais e matrizes de proteínas de membrana com a nova tecnologia em um futuro próximo. Escolhemos a tecnologia do Arrayjet porque precisávamos quintuplicar nossa capacidade, de preferência com um instrumento, e os recursos de alta tecnologia, precisão e facilidade de uso do Arrayjet foram um benefício óbvio.

“Uma das vantagens adicionais da estrutura empresarial da Arrayjet é que ela oferece impressão interna por meio do Arrayjet Advance. Conseguimos realizar vários estudos ao longo de vários meses para reafirmar nossa crença de que a tecnologia melhoraria muitas facetas de nossa operação.”

O Dr. Heng Zhu, professor da Escola de Medicina Johns Hopkins elabora: “O dispositivo de aspiração de amostras Jetspyder™ da Arrayjet elimina efetivamente qualquer contaminação cruzada entre amostras de proteínas, de modo que a qualidade de nossos microarrays melhorou significativamente.

“Anteriormente, só podíamos produzir 150 slides de qualidade aceitável em uma tiragem, o que é um ritmo muito lento para a escala e o crescimento da demanda atual e futura. Ser capaz de imprimir rapidamente até 1.000 slides de maneira altamente eficiente foi incrivelmente atraente para nós.”

Sobre a Arrayjet Ltda

A Arrayjet fornece instrumentos e serviços para as indústrias farmacêutica, de diagnóstico e ciências da vida. Nossos produtos usam tecnologia de jato de tinta para manuseio de líquidos de picolitros de precisão. A Arrayjet se concentra na impressão de amostras para criar ferramentas para triagem genômica e proteômica, estratificação de pacientes e diagnóstico clínico.

A tecnologia de impressão proprietária é totalmente automatizada e oferece benefícios de facilidade de uso, precisão, reprodutibilidade, eficiência de fabricação e controle total do processo.

A tecnologia patenteada da Arrayjet aspira e imprime simultaneamente várias amostras em tempo real. Esta é uma plataforma comprovada e sua bioimpressão sem contato é ideal para fabricação de microarrays e microplacas de 96 poços; bem como bioimpressão em biossensores, biochips, dispositivos MEMS, dispositivos microfluídicos, folhas de membrana e em aplicações de nanopoços. A maioria dos substratos são compatíveis com a tecnologia.

Os instrumentos Arrayjet oferecem o maior tamanho de lote de fabricação de até 1.000 lâminas, permitindo que mais de 18.400 amostras sejam carregadas de uma só vez. Os instrumentos são modulares e escaláveis, permitindo que os clientes aumentem a capacidade à medida que seus requisitos crescem. Eles combinam a instrumentação mais rápida e confiável do mercado com a versatilidade de imprimir qualquer tipo de amostra biológica em qualquer substrato sólido.


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Artigo de News Medical.


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