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Os coronavírus (CoVs) são um grupo variado de vírus de ácido ribonucleico (RNA) de sentido positivo de fita simples que podem infectar humanos e outros mamíferos. Vários CoVs diferentes apareceram em populações humanas nos últimos 20 anos.

Sabe-se há muito tempo que os CoVs humanos circulantes sazonalmente, incluindo HCoV-229E, HCoV-OC43, HCoV-NL63 e HCoV-HKU1, causam infecções menores do trato respiratório. O coronavírus da síndrome respiratória aguda grave (SARS-CoV), o coronavírus da síndrome respiratória do Oriente Médio (MERS-CoV) e o SARS-CoV-2, por outro lado, são altamente patogênicos.

O SARS-CoV-2 foi inicialmente identificado como o vírus responsável pelo surto da doença de coronavírus 2019 (COVID-19) que começou em Wuhan, China, em dezembro de 2019. O COVID-19 foi declarado uma pandemia pela Organização Mundial da Saúde em março de 2020, com mais de 375 milhões de casos confirmados e quase 5,7 milhões de mortes documentadas em 31 de janeiro de 2022. Alterações na sequência, particularmente na proteína spike , e a subsequente introdução de novas variantes foram descobertas por sequenciamento de genoma completo (WGS) em larga escala de o SARS-CoV-2.

A variante Omicron, que é a variante identificada mais recentemente do SARS-CoV-2, está associada a uma proliferação excepcional. Como resultado, governos de todo o mundo estão adotando testes rápidos de antígenos para identificar rapidamente os indivíduos infectados e reduzir a transmissão do vírus.

Até o momento, apenas alguns estudos avaliaram a precisão dos testes de antígeno na detecção de variantes de SARS-CoV-2, particularmente Omicron. No estudo atual publicado no servidor de pré-impressão medRxiv* , os pesquisadores determinaram a sensibilidade analítica de um antígeno rápido marcado com CE com as variantes Omicron, Delta, Alpha e Gamma. Suas descobertas mostram que o teste de antígeno é bem-sucedido na detecção de variantes do SARS-CoV-2, incluindo a variante Omicron atualmente dominante, apesar de pequenas diferenças na sensibilidade.

Sobre o estudo

No estudo atual, os autores usaram isolados clínicos de Omicron, Delta, Alpha e Gamma para determinar a sensibilidade analítica de um teste rápido de antígeno com variantes de SARS-CoV-2. Cada variante foi diluída para amostras de teste de 100.000 PFU/mL, depois diluída em série dez vezes para obter amostras de teste de 10.000, 1.000, 100, 10 e 1 PFU/mL.

Os limites de detecção foram determinados aplicando 100 litros de amostras de teste a cada teste rápido de antígeno. Antes que os resultados fossem classificados visualmente e as fotos fossem coletadas, os testes de antígeno reagiram por um total de 15 minutos.

A variante Delta apresentou o maior limite de detecção em 1.000 PFU/mL, seguida da variante Omicron em 100 PFU/mL, de acordo com o teste rápido de antígeno. A 10 PU/mL, o teste de antígeno rápido exibiu os limites de detecção mais baixos contra as variantes Alfa e Gama.

Ao usar as amostras de teste de 1 PFU/mL das variantes Alfa e Gama, bem como o tampão do kit sozinho, o teste rápido de antígeno deu negativo. Os resultados de pontuação visual foram apoiados por análise de imagem de intensidades de sinal de teste.

Implicações

Como a proteína do nucleocapsídeo (N) do SARS-CoV-2 é uma das proteínas estruturais mais comumente produzidas, é um excelente alvo para detecção viral em pacientes infectados. Como resultado, a maioria dos ensaios de antígeno foi estabelecida para SARS-CoV-2 N; no entanto, alterações nessa proteína podem afetar a detecção do vírus.

As mutações R230K e G204R em N foram encontradas em mais de 85% das sequências Omicron, Alpha e Gamma. Essas mutações, por outro lado, foram encontradas em menos de 0,1% das sequências Delta. Esses achados podem explicar por que o teste de antígeno delta rápido tem uma sensibilidade analítica menor do que as outras variantes.

Outra possibilidade é que os estoques virais utilizados no presente estudo continham partículas não infecciosas, resultando em níveis variados de N que poderiam afetar a intensidade do sinal dos resultados do teste. Mais pesquisas são necessárias para determinar quais mutações na proteína N das variantes do SARS-CoV-2 têm um impacto negativo nos limites de detecção de testes rápidos de antígeno.

Além disso, são necessárias investigações que avaliem o desempenho de testes rápidos de antígeno utilizando amostras de swab nasal ou orofaríngeo de pacientes confirmados com COVID-19 por reação em cadeia da polimerase transcriptase reversa (RT-PCR). Em conjunto, o teste de antígeno utilizado neste estudo é bem-sucedido na detecção de variantes do SARS-CoV-2, apesar de pequenas alterações na sensibilidade analítica.

*Notícia importante

O medRxiv publica relatórios científicos preliminares que não são revisados ​​por pares e, portanto, não devem ser considerados conclusivos, guiar a prática clínica/comportamento relacionado à saúde ou tratados como informações estabelecidas.

Artigo retirado de News Medical.


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